Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
CACNA1SQ13698 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CACNA1SQ13698 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CACNA1SQ13698 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CACNA1SQ13698 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CACNA1SQ13698 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
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