Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
FHL3Q13643 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
FHL3Q13643 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FHL3Q13643 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms