Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TOP3AQ13472 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TOP3AQ13472 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TOP3AQ13472 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TOP3AQ13472 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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