Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MRPL49Q13405 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRPL49Q13405 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPL49Q13405 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
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