Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GRIK3Q13003 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GRIK3Q13003 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GRIK3Q13003 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GRIK3Q13003 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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