Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FMODQ06828 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FMODQ06828 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FMODQ06828 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FMODQ06828 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FMODQ06828 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FMODQ06828 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FMODQ06828 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FMODQ06828 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FMODQ06828 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FMODQ06828 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FMODQ06828 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FMODQ06828 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FMODQ06828 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FMODQ06828 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FMODQ06828 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FMODQ06828 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FMODQ06828 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FMODQ06828 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FMODQ06828 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FMODQ06828 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FMODQ06828 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FMODQ06828 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FMODQ06828 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FMODQ06828 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FMODQ06828 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FMODQ06828 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FMODQ06828 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FMODQ06828 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FMODQ06828 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FMODQ06828 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FMODQ06828 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FMODQ06828 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FMODQ06828 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FMODQ06828 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FMODQ06828 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FMODQ06828 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FMODQ06828 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FMODQ06828 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FMODQ06828 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FMODQ06828 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FMODQ06828 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FMODQ06828 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FMODQ06828 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FMODQ06828 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FMODQ06828 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FMODQ06828 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FMODQ06828 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FMODQ06828 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FMODQ06828 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FMODQ06828 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FMODQ06828 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FMODQ06828 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FMODQ06828 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FMODQ06828 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FMODQ06828 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FMODQ06828 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
FMODQ06828 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FMODQ06828 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FMODQ06828 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FMODQ06828 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FMODQ06828 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FMODQ06828 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FMODQ06828 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FMODQ06828 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FMODQ06828 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FMODQ06828 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FMODQ06828 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FMODQ06828 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FMODQ06828 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FMODQ06828 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FMODQ06828 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FMODQ06828 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FMODQ06828 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FMODQ06828 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms