Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC43.49■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC43.47■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC43.46■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC43.45■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
ERCC6Q03468 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC43.42■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC43.41■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC43.39■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
ERCC6Q03468 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC43.32■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC43.32■■■■■ 4.53
ERCC6Q03468 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC43.3■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC43.28■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
ERCC6Q03468 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC43.19■■■■■ 4.51
ERCC6Q03468 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.15■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
ERCC6Q03468 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
ERCC6Q03468 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms