Protein–RNA interactions for Protein: Q03167

TGFBR3, Transforming growth factor beta receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR3Q03167 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TGFBR3Q03167 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TGFBR3Q03167 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TGFBR3Q03167 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TGFBR3Q03167 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms