Protein–RNA interactions for Protein: Q02962

PAX2, Paired box protein Pax-2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX2Q02962 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PAX2Q02962 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAX2Q02962 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PAX2Q02962 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms