Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SP4Q02446 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SP4Q02446 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP4Q02446 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP4Q02446 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP4Q02446 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP4Q02446 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SP4Q02446 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SP4Q02446 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP4Q02446 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP4Q02446 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP4Q02446 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP4Q02446 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SP4Q02446 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SP4Q02446 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SP4Q02446 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP4Q02446 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SP4Q02446 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP4Q02446 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP4Q02446 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SP4Q02446 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SP4Q02446 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SP4Q02446 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SP4Q02446 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SP4Q02446 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP4Q02446 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP4Q02446 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP4Q02446 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP4Q02446 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP4Q02446 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP4Q02446 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP4Q02446 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SP4Q02446 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SP4Q02446 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP4Q02446 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP4Q02446 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP4Q02446 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP4Q02446 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SP4Q02446 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SP4Q02446 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SP4Q02446 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SP4Q02446 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SP4Q02446 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SP4Q02446 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP4Q02446 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SP4Q02446 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SP4Q02446 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP4Q02446 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SP4Q02446 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP4Q02446 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP4Q02446 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP4Q02446 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP4Q02446 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP4Q02446 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP4Q02446 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SP4Q02446 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP4Q02446 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP4Q02446 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SP4Q02446 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP4Q02446 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP4Q02446 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP4Q02446 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP4Q02446 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SP4Q02446 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SP4Q02446 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SP4Q02446 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SP4Q02446 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SP4Q02446 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SP4Q02446 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SP4Q02446 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SP4Q02446 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SP4Q02446 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SP4Q02446 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SP4Q02446 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SP4Q02446 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SP4Q02446 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SP4Q02446 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SP4Q02446 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SP4Q02446 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SP4Q02446 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
SP4Q02446 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SP4Q02446 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SP4Q02446 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms