Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IRF9Q00978 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IRF9Q00978 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IRF9Q00978 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms