Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VBP1P61758 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VBP1P61758 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VBP1P61758 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VBP1P61758 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VBP1P61758 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VBP1P61758 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VBP1P61758 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VBP1P61758 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VBP1P61758 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VBP1P61758 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
VBP1P61758 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VBP1P61758 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VBP1P61758 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VBP1P61758 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VBP1P61758 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VBP1P61758 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VBP1P61758 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VBP1P61758 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VBP1P61758 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VBP1P61758 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VBP1P61758 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VBP1P61758 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VBP1P61758 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VBP1P61758 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VBP1P61758 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VBP1P61758 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VBP1P61758 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VBP1P61758 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VBP1P61758 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VBP1P61758 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VBP1P61758 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VBP1P61758 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VBP1P61758 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VBP1P61758 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VBP1P61758 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VBP1P61758 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VBP1P61758 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VBP1P61758 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VBP1P61758 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VBP1P61758 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VBP1P61758 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
VBP1P61758 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VBP1P61758 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VBP1P61758 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VBP1P61758 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VBP1P61758 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
VBP1P61758 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VBP1P61758 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VBP1P61758 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VBP1P61758 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VBP1P61758 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VBP1P61758 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VBP1P61758 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VBP1P61758 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VBP1P61758 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VBP1P61758 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VBP1P61758 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VBP1P61758 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VBP1P61758 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VBP1P61758 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VBP1P61758 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VBP1P61758 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VBP1P61758 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VBP1P61758 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VBP1P61758 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VBP1P61758 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VBP1P61758 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VBP1P61758 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VBP1P61758 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VBP1P61758 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VBP1P61758 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VBP1P61758 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VBP1P61758 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VBP1P61758 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VBP1P61758 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VBP1P61758 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VBP1P61758 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VBP1P61758 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VBP1P61758 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VBP1P61758 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VBP1P61758 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VBP1P61758 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VBP1P61758 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VBP1P61758 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VBP1P61758 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VBP1P61758 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VBP1P61758 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VBP1P61758 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VBP1P61758 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VBP1P61758 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VBP1P61758 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VBP1P61758 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VBP1P61758 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VBP1P61758 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VBP1P61758 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VBP1P61758 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VBP1P61758 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VBP1P61758 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VBP1P61758 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms