Protein–RNA interactions for Protein: P61225

RAP2B, Ras-related protein Rap-2b, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP2BP61225 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RAP2BP61225 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAP2BP61225 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAP2BP61225 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms