Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DEFA3P59666 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DEFA3P59666 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DEFA3P59666 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DEFA3P59666 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms