Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF3P57682 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF3P57682 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF3P57682 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF3P57682 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
KLF3P57682 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF3P57682 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF3P57682 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF3P57682 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF3P57682 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF3P57682 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
KLF3P57682 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF3P57682 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF3P57682 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
KLF3P57682 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF3P57682 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF3P57682 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF3P57682 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF3P57682 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF3P57682 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF3P57682 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
KLF3P57682 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
KLF3P57682 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF3P57682 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF3P57682 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
KLF3P57682 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF3P57682 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
KLF3P57682 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF3P57682 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF3P57682 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF3P57682 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF3P57682 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF3P57682 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
KLF3P57682 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF3P57682 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF3P57682 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF3P57682 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF3P57682 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF3P57682 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF3P57682 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KLF3P57682 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF3P57682 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF3P57682 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF3P57682 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF3P57682 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF3P57682 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF3P57682 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KLF3P57682 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KLF3P57682 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KLF3P57682 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KLF3P57682 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF3P57682 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF3P57682 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF3P57682 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF3P57682 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF3P57682 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF3P57682 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KLF3P57682 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF3P57682 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLF3P57682 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms