Protein–RNA interactions for Protein: P56715

RP1, Oxygen-regulated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP1P56715 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RP1P56715 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RP1P56715 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP1P56715 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RP1P56715 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP1P56715 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP1P56715 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RP1P56715 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP1P56715 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP1P56715 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RP1P56715 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP1P56715 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP1P56715 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
RP1P56715 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP1P56715 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP1P56715 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RP1P56715 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RP1P56715 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RP1P56715 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RP1P56715 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
RP1P56715 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RP1P56715 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RP1P56715 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RP1P56715 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RP1P56715 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP1P56715 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP1P56715 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP1P56715 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RP1P56715 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP1P56715 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP1P56715 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP1P56715 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP1P56715 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP1P56715 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RP1P56715 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RP1P56715 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP1P56715 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP1P56715 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP1P56715 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP1P56715 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP1P56715 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RP1P56715 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RP1P56715 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RP1P56715 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RP1P56715 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RP1P56715 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RP1P56715 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RP1P56715 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP1P56715 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP1P56715 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP1P56715 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RP1P56715 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP1P56715 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP1P56715 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP1P56715 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP1P56715 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RP1P56715 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RP1P56715 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP1P56715 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RP1P56715 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RP1P56715 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RP1P56715 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RP1P56715 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RP1P56715 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RP1P56715 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RP1P56715 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RP1P56715 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RP1P56715 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP1P56715 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP1P56715 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP1P56715 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP1P56715 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP1P56715 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RP1P56715 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP1P56715 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP1P56715 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP1P56715 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP1P56715 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP1P56715 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP1P56715 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP1P56715 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RP1P56715 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RP1P56715 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RP1P56715 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RP1P56715 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RP1P56715 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP1P56715 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP1P56715 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP1P56715 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP1P56715 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP1P56715 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RP1P56715 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms