Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX3P56589 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX3P56589 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX3P56589 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PEX3P56589 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PEX3P56589 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX3P56589 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX3P56589 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX3P56589 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX3P56589 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX3P56589 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PEX3P56589 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PEX3P56589 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX3P56589 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX3P56589 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX3P56589 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX3P56589 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PEX3P56589 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX3P56589 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX3P56589 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX3P56589 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PEX3P56589 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PEX3P56589 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX3P56589 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX3P56589 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX3P56589 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PEX3P56589 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX3P56589 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX3P56589 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX3P56589 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX3P56589 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX3P56589 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX3P56589 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PEX3P56589 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PEX3P56589 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PEX3P56589 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX3P56589 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PEX3P56589 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX3P56589 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX3P56589 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX3P56589 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX3P56589 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX3P56589 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX3P56589 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX3P56589 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PEX3P56589 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PEX3P56589 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX3P56589 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX3P56589 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX3P56589 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PEX3P56589 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX3P56589 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX3P56589 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX3P56589 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX3P56589 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PEX3P56589 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX3P56589 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX3P56589 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX3P56589 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PEX3P56589 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX3P56589 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX3P56589 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX3P56589 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PEX3P56589 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX3P56589 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PEX3P56589 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX3P56589 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PEX3P56589 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PEX3P56589 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PEX3P56589 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX3P56589 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PEX3P56589 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX3P56589 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX3P56589 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX3P56589 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PEX3P56589 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX3P56589 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX3P56589 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX3P56589 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PEX3P56589 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms