Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ITGA1P56199 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ITGA1P56199 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ITGA1P56199 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGA1P56199 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGA1P56199 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms