Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTEP56180 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTEP56180 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTEP56180 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTEP56180 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTEP56180 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTEP56180 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTEP56180 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TPTEP56180 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTEP56180 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTEP56180 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTEP56180 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TPTEP56180 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTEP56180 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTEP56180 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTEP56180 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTEP56180 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTEP56180 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTEP56180 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTEP56180 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TPTEP56180 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTEP56180 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTEP56180 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTEP56180 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTEP56180 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTEP56180 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TPTEP56180 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTEP56180 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTEP56180 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTEP56180 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTEP56180 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTEP56180 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTEP56180 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TPTEP56180 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTEP56180 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTEP56180 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTEP56180 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTEP56180 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTEP56180 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTEP56180 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TPTEP56180 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TPTEP56180 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTEP56180 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTEP56180 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTEP56180 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTEP56180 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTEP56180 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TPTEP56180 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPTEP56180 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTEP56180 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TPTEP56180 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TPTEP56180 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TPTEP56180 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTEP56180 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTEP56180 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTEP56180 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTEP56180 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTEP56180 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTEP56180 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TPTEP56180 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTEP56180 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTEP56180 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTEP56180 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTEP56180 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTEP56180 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TPTEP56180 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTEP56180 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTEP56180 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTEP56180 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTEP56180 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTEP56180 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTEP56180 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTEP56180 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TPTEP56180 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTEP56180 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTEP56180 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTEP56180 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TPTEP56180 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPTEP56180 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
TPTEP56180 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTEP56180 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTEP56180 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTEP56180 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTEP56180 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTEP56180 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTEP56180 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TPTEP56180 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPTEP56180 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPTEP56180 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPTEP56180 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPTEP56180 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TPTEP56180 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPTEP56180 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TPTEP56180 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPTEP56180 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPTEP56180 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPTEP56180 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPTEP56180 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPTEP56180 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TPTEP56180 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms