Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RAD23BP54727 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAD23BP54727 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAD23BP54727 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAD23BP54727 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms