Protein–RNA interactions for Protein: P54619

PRKAG1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAG1P54619 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRKAG1P54619 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRKAG1P54619 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRKAG1P54619 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAG1P54619 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms