Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24CP53992 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24CP53992 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24CP53992 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SEC24CP53992 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms