Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP98P52948 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP98P52948 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP98P52948 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP98P52948 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP98P52948 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NUP98P52948 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NUP98P52948 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUP98P52948 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUP98P52948 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUP98P52948 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NUP98P52948 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
NUP98P52948 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
NUP98P52948 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP98P52948 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP98P52948 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP98P52948 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP98P52948 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NUP98P52948 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP98P52948 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP98P52948 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NUP98P52948 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP98P52948 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP98P52948 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP98P52948 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP98P52948 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP98P52948 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NUP98P52948 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP98P52948 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP98P52948 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP98P52948 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP98P52948 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP98P52948 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP98P52948 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NUP98P52948 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP98P52948 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC31.11■■■□□ 2.57
NUP98P52948 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP98P52948 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP98P52948 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP98P52948 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP98P52948 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NUP98P52948 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP98P52948 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP98P52948 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP98P52948 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP98P52948 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP98P52948 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP98P52948 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NUP98P52948 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP98P52948 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP98P52948 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP98P52948 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP98P52948 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP98P52948 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NUP98P52948 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP98P52948 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NUP98P52948 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NUP98P52948 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP98P52948 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP98P52948 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP98P52948 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP98P52948 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP98P52948 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NUP98P52948 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP98P52948 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP98P52948 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NUP98P52948 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP98P52948 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP98P52948 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP98P52948 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
NUP98P52948 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP98P52948 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP98P52948 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP98P52948 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP98P52948 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NUP98P52948 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP98P52948 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP98P52948 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
NUP98P52948 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP98P52948 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP98P52948 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP98P52948 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP98P52948 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
NUP98P52948 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP98P52948 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NUP98P52948 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP98P52948 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP98P52948 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP98P52948 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP98P52948 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP98P52948 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP98P52948 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP98P52948 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
NUP98P52948 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP98P52948 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP98P52948 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
NUP98P52948 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP98P52948 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP98P52948 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
NUP98P52948 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms