Protein–RNA interactions for Protein: P51798

CLCN7, H(+)/Cl(-) exchange transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN7P51798 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCN7P51798 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CLCN7P51798 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLCN7P51798 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CLCN7P51798 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN7P51798 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN7P51798 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN7P51798 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN7P51798 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN7P51798 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CLCN7P51798 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CLCN7P51798 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms