Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GCLCP48506 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCLCP48506 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GCLCP48506 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCLCP48506 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCLCP48506 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GCLCP48506 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCLCP48506 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCLCP48506 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCLCP48506 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCLCP48506 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCLCP48506 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GCLCP48506 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCLCP48506 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCLCP48506 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCLCP48506 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GCLCP48506 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCLCP48506 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GCLCP48506 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCLCP48506 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCLCP48506 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCLCP48506 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GCLCP48506 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GCLCP48506 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GCLCP48506 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCLCP48506 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCLCP48506 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCLCP48506 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCLCP48506 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCLCP48506 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GCLCP48506 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCLCP48506 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GCLCP48506 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
GCLCP48506 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GCLCP48506 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCLCP48506 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCLCP48506 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCLCP48506 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCLCP48506 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCLCP48506 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GCLCP48506 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GCLCP48506 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCLCP48506 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCLCP48506 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCLCP48506 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCLCP48506 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCLCP48506 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCLCP48506 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GCLCP48506 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCLCP48506 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCLCP48506 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCLCP48506 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCLCP48506 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCLCP48506 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCLCP48506 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GCLCP48506 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GCLCP48506 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCLCP48506 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCLCP48506 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GCLCP48506 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GCLCP48506 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCLCP48506 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCLCP48506 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCLCP48506 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCLCP48506 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GCLCP48506 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCLCP48506 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCLCP48506 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCLCP48506 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GCLCP48506 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCLCP48506 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCLCP48506 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GCLCP48506 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCLCP48506 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCLCP48506 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCLCP48506 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GCLCP48506 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCLCP48506 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GCLCP48506 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCLCP48506 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCLCP48506 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GCLCP48506 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCLCP48506 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GCLCP48506 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCLCP48506 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCLCP48506 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GCLCP48506 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms