Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TM4SF4P48230 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TM4SF4P48230 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TM4SF4P48230 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TM4SF4P48230 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TM4SF4P48230 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms