Protein–RNA interactions for Protein: P48147

PREP, Prolyl endopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREPP48147 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PREPP48147 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PREPP48147 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PREPP48147 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PREPP48147 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PREPP48147 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PREPP48147 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PREPP48147 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PREPP48147 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PREPP48147 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREPP48147 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREPP48147 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREPP48147 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PREPP48147 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREPP48147 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PREPP48147 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREPP48147 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PREPP48147 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREPP48147 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREPP48147 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREPP48147 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PREPP48147 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PREPP48147 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PREPP48147 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PREPP48147 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREPP48147 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREPP48147 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREPP48147 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREPP48147 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREPP48147 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREPP48147 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREPP48147 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREPP48147 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREPP48147 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREPP48147 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREPP48147 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREPP48147 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREPP48147 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREPP48147 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PREPP48147 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREPP48147 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PREPP48147 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PREPP48147 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PREPP48147 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PREPP48147 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREPP48147 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREPP48147 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREPP48147 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREPP48147 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREPP48147 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREPP48147 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PREPP48147 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PREPP48147 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PREPP48147 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PREPP48147 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PREPP48147 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREPP48147 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PREPP48147 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PREPP48147 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PREPP48147 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PREPP48147 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PREPP48147 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PREPP48147 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PREPP48147 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PREPP48147 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PREPP48147 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms