Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGRP47804 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGRP47804 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGRP47804 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RGRP47804 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGRP47804 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGRP47804 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGRP47804 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGRP47804 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RGRP47804 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGRP47804 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGRP47804 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RGRP47804 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGRP47804 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RGRP47804 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGRP47804 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGRP47804 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGRP47804 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGRP47804 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGRP47804 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RGRP47804 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGRP47804 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGRP47804 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RGRP47804 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RGRP47804 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGRP47804 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGRP47804 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RGRP47804 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGRP47804 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGRP47804 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGRP47804 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RGRP47804 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGRP47804 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGRP47804 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGRP47804 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGRP47804 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGRP47804 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RGRP47804 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGRP47804 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGRP47804 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGRP47804 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGRP47804 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGRP47804 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RGRP47804 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RGRP47804 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RGRP47804 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGRP47804 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGRP47804 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGRP47804 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGRP47804 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RGRP47804 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGRP47804 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGRP47804 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RGRP47804 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
RGRP47804 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGRP47804 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGRP47804 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGRP47804 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGRP47804 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGRP47804 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RGRP47804 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGRP47804 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGRP47804 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RGRP47804 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGRP47804 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGRP47804 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGRP47804 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGRP47804 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RGRP47804 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGRP47804 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGRP47804 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGRP47804 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGRP47804 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGRP47804 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RGRP47804 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGRP47804 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGRP47804 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGRP47804 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGRP47804 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGRP47804 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGRP47804 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RGRP47804 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGRP47804 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGRP47804 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGRP47804 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGRP47804 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGRP47804 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RGRP47804 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGRP47804 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RGRP47804 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RGRP47804 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RGRP47804 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms