Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NEDD4P46934 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NEDD4P46934 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NEDD4P46934 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NEDD4P46934 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.23
NEDD4P46934 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
NEDD4P46934 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms