Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GNPDA1P46926 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GNPDA1P46926 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GNPDA1P46926 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GNPDA1P46926 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms