Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPD2P43304 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPD2P43304 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPD2P43304 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
GPD2P43304 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GPD2P43304 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GPD2P43304 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPD2P43304 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26■■□□□ 1.75
GPD2P43304 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPD2P43304 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPD2P43304 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPD2P43304 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPD2P43304 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPD2P43304 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GPD2P43304 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPD2P43304 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPD2P43304 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GPD2P43304 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPD2P43304 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPD2P43304 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPD2P43304 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPD2P43304 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
GPD2P43304 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GPD2P43304 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPD2P43304 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPD2P43304 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPD2P43304 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPD2P43304 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GPD2P43304 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPD2P43304 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPD2P43304 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GPD2P43304 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPD2P43304 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPD2P43304 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
GPD2P43304 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPD2P43304 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPD2P43304 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPD2P43304 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GPD2P43304 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GPD2P43304 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPD2P43304 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPD2P43304 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GPD2P43304 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
GPD2P43304 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPD2P43304 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPD2P43304 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPD2P43304 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GPD2P43304 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GPD2P43304 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPD2P43304 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GPD2P43304 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GPD2P43304 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPD2P43304 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GPD2P43304 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GPD2P43304 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPD2P43304 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPD2P43304 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPD2P43304 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPD2P43304 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPD2P43304 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GPD2P43304 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPD2P43304 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPD2P43304 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPD2P43304 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPD2P43304 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPD2P43304 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPD2P43304 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPD2P43304 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GPD2P43304 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPD2P43304 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPD2P43304 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPD2P43304 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GPD2P43304 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPD2P43304 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPD2P43304 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GPD2P43304 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms