Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSKP43235 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTSKP43235 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSKP43235 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTSKP43235 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSKP43235 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSKP43235 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSKP43235 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSKP43235 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTSKP43235 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSKP43235 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSKP43235 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSKP43235 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSKP43235 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSKP43235 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSKP43235 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSKP43235 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTSKP43235 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSKP43235 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSKP43235 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSKP43235 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSKP43235 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSKP43235 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSKP43235 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTSKP43235 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSKP43235 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSKP43235 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSKP43235 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTSKP43235 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSKP43235 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSKP43235 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSKP43235 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTSKP43235 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSKP43235 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSKP43235 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSKP43235 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSKP43235 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTSKP43235 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSKP43235 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSKP43235 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSKP43235 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSKP43235 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CTSKP43235 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSKP43235 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSKP43235 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSKP43235 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSKP43235 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSKP43235 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSKP43235 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSKP43235 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CTSKP43235 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSKP43235 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSKP43235 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSKP43235 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSKP43235 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSKP43235 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSKP43235 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSKP43235 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CTSKP43235 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSKP43235 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSKP43235 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSKP43235 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSKP43235 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSKP43235 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CTSKP43235 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CTSKP43235 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSKP43235 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSKP43235 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSKP43235 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSKP43235 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CTSKP43235 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSKP43235 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSKP43235 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSKP43235 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSKP43235 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSKP43235 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSKP43235 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSKP43235 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CTSKP43235 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSKP43235 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSKP43235 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSKP43235 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CTSKP43235 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSKP43235 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSKP43235 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSKP43235 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSKP43235 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSKP43235 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSKP43235 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CTSKP43235 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSKP43235 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSKP43235 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSKP43235 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CTSKP43235 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSKP43235 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSKP43235 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSKP43235 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CTSKP43235 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSKP43235 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CTSKP43235 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms