Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PIK3CBP42338 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PIK3CBP42338 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PIK3CBP42338 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms