Protein–RNA interactions for Protein: P41226

UBA7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA7P41226 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBA7P41226 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBA7P41226 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBA7P41226 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBA7P41226 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBA7P41226 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBA7P41226 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
UBA7P41226 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBA7P41226 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
UBA7P41226 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBA7P41226 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBA7P41226 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
UBA7P41226 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
UBA7P41226 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBA7P41226 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBA7P41226 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
UBA7P41226 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
UBA7P41226 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBA7P41226 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBA7P41226 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
UBA7P41226 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBA7P41226 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBA7P41226 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
UBA7P41226 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBA7P41226 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBA7P41226 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
UBA7P41226 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBA7P41226 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBA7P41226 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBA7P41226 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBA7P41226 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
UBA7P41226 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBA7P41226 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBA7P41226 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBA7P41226 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
UBA7P41226 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBA7P41226 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBA7P41226 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBA7P41226 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBA7P41226 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
UBA7P41226 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
UBA7P41226 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBA7P41226 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
UBA7P41226 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBA7P41226 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
UBA7P41226 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBA7P41226 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBA7P41226 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBA7P41226 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBA7P41226 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBA7P41226 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBA7P41226 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBA7P41226 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBA7P41226 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBA7P41226 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBA7P41226 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBA7P41226 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
UBA7P41226 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBA7P41226 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBA7P41226 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBA7P41226 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBA7P41226 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBA7P41226 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
UBA7P41226 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBA7P41226 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBA7P41226 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBA7P41226 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBA7P41226 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBA7P41226 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBA7P41226 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBA7P41226 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.55■■■□□ 2
UBA7P41226 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBA7P41226 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBA7P41226 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBA7P41226 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBA7P41226 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
UBA7P41226 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBA7P41226 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBA7P41226 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
UBA7P41226 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBA7P41226 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBA7P41226 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
UBA7P41226 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBA7P41226 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
UBA7P41226 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBA7P41226 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
UBA7P41226 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBA7P41226 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBA7P41226 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBA7P41226 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBA7P41226 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms