Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THPOP40225 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THPOP40225 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
THPOP40225 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THPOP40225 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THPOP40225 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THPOP40225 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
THPOP40225 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THPOP40225 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
THPOP40225 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
THPOP40225 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
THPOP40225 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THPOP40225 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THPOP40225 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
THPOP40225 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THPOP40225 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THPOP40225 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THPOP40225 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
THPOP40225 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THPOP40225 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THPOP40225 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THPOP40225 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
THPOP40225 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
THPOP40225 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THPOP40225 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THPOP40225 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THPOP40225 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THPOP40225 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THPOP40225 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
THPOP40225 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THPOP40225 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THPOP40225 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THPOP40225 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
THPOP40225 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THPOP40225 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THPOP40225 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THPOP40225 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THPOP40225 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THPOP40225 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
THPOP40225 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THPOP40225 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THPOP40225 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
THPOP40225 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
THPOP40225 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THPOP40225 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THPOP40225 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THPOP40225 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THPOP40225 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THPOP40225 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THPOP40225 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THPOP40225 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THPOP40225 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THPOP40225 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THPOP40225 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THPOP40225 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
THPOP40225 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THPOP40225 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THPOP40225 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
THPOP40225 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THPOP40225 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
THPOP40225 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THPOP40225 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
THPOP40225 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THPOP40225 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
THPOP40225 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THPOP40225 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THPOP40225 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
THPOP40225 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THPOP40225 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THPOP40225 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THPOP40225 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THPOP40225 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
THPOP40225 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THPOP40225 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THPOP40225 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
THPOP40225 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THPOP40225 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
THPOP40225 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THPOP40225 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THPOP40225 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THPOP40225 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
THPOP40225 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
THPOP40225 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THPOP40225 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
THPOP40225 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
THPOP40225 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
THPOP40225 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
THPOP40225 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
THPOP40225 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
THPOP40225 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THPOP40225 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THPOP40225 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THPOP40225 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THPOP40225 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
THPOP40225 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THPOP40225 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THPOP40225 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
THPOP40225 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THPOP40225 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
THPOP40225 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms