Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGP37231 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGP37231 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGP37231 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGP37231 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGP37231 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGP37231 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARGP37231 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGP37231 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGP37231 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGP37231 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGP37231 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARGP37231 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGP37231 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGP37231 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGP37231 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGP37231 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGP37231 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARGP37231 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGP37231 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGP37231 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGP37231 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGP37231 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARGP37231 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARGP37231 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGP37231 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARGP37231 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGP37231 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGP37231 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGP37231 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARGP37231 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPARGP37231 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPARGP37231 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPARGP37231 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPARGP37231 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPARGP37231 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PPARGP37231 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGP37231 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGP37231 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGP37231 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGP37231 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PPARGP37231 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGP37231 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGP37231 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGP37231 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGP37231 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PPARGP37231 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPARGP37231 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PPARGP37231 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPARGP37231 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PPARGP37231 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGP37231 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGP37231 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGP37231 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PPARGP37231 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPARGP37231 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PPARGP37231 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGP37231 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGP37231 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGP37231 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGP37231 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PPARGP37231 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGP37231 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGP37231 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGP37231 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGP37231 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGP37231 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PPARGP37231 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PPARGP37231 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPARGP37231 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPARGP37231 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PPARGP37231 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGP37231 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGP37231 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGP37231 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGP37231 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGP37231 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PPARGP37231 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PPARGP37231 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms