Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NUP62P37198 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP62P37198 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP62P37198 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP62P37198 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP62P37198 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
NUP62P37198 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP62P37198 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP62P37198 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP62P37198 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP62P37198 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP62P37198 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP62P37198 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP62P37198 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NUP62P37198 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP62P37198 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP62P37198 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP62P37198 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP62P37198 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NUP62P37198 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP62P37198 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP62P37198 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP62P37198 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NUP62P37198 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP62P37198 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP62P37198 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NUP62P37198 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP62P37198 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP62P37198 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP62P37198 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP62P37198 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NUP62P37198 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NUP62P37198 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP62P37198 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP62P37198 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP62P37198 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP62P37198 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NUP62P37198 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP62P37198 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP62P37198 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NUP62P37198 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP62P37198 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP62P37198 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP62P37198 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP62P37198 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP62P37198 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP62P37198 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NUP62P37198 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP62P37198 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NUP62P37198 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP62P37198 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
NUP62P37198 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP62P37198 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP62P37198 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP62P37198 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NUP62P37198 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP62P37198 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP62P37198 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP62P37198 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP62P37198 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP62P37198 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP62P37198 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NUP62P37198 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP62P37198 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP62P37198 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NUP62P37198 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP62P37198 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP62P37198 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP62P37198 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP62P37198 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP62P37198 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP62P37198 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NUP62P37198 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NUP62P37198 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP62P37198 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP62P37198 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP62P37198 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP62P37198 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP62P37198 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP62P37198 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NUP62P37198 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms