Protein–RNA interactions for Protein: P36956

SREBF1, Sterol regulatory element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF1P36956 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SREBF1P36956 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SREBF1P36956 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SREBF1P36956 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms