Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1E1P36543 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP6V1E1P36543 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP6V1E1P36543 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP6V1E1P36543 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms