Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRIM23P36406 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM23P36406 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM23P36406 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM23P36406 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms