Protein–RNA interactions for Protein: P35558

PCK1, Phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP], humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK1P35558 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCK1P35558 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCK1P35558 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCK1P35558 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCK1P35558 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCK1P35558 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCK1P35558 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PCK1P35558 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCK1P35558 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCK1P35558 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCK1P35558 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCK1P35558 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCK1P35558 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PCK1P35558 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK1P35558 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK1P35558 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK1P35558 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK1P35558 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK1P35558 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK1P35558 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK1P35558 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PCK1P35558 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCK1P35558 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCK1P35558 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCK1P35558 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCK1P35558 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PCK1P35558 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCK1P35558 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCK1P35558 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCK1P35558 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCK1P35558 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCK1P35558 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCK1P35558 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PCK1P35558 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCK1P35558 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCK1P35558 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCK1P35558 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PCK1P35558 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCK1P35558 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCK1P35558 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCK1P35558 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PCK1P35558 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCK1P35558 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCK1P35558 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCK1P35558 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PCK1P35558 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PCK1P35558 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCK1P35558 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PCK1P35558 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCK1P35558 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PCK1P35558 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCK1P35558 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCK1P35558 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PCK1P35558 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCK1P35558 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCK1P35558 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PCK1P35558 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCK1P35558 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCK1P35558 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCK1P35558 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCK1P35558 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PCK1P35558 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCK1P35558 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCK1P35558 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PCK1P35558 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCK1P35558 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCK1P35558 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCK1P35558 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCK1P35558 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCK1P35558 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCK1P35558 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCK1P35558 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCK1P35558 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCK1P35558 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCK1P35558 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PCK1P35558 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCK1P35558 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCK1P35558 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCK1P35558 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCK1P35558 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCK1P35558 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCK1P35558 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCK1P35558 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCK1P35558 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCK1P35558 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCK1P35558 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCK1P35558 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms