Protein–RNA interactions for Protein: P35442

THBS2, Thrombospondin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS2P35442 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS2P35442 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
THBS2P35442 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS2P35442 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS2P35442 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS2P35442 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS2P35442 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
THBS2P35442 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
THBS2P35442 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
THBS2P35442 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS2P35442 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS2P35442 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS2P35442 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS2P35442 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS2P35442 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS2P35442 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS2P35442 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
THBS2P35442 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS2P35442 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS2P35442 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS2P35442 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS2P35442 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
THBS2P35442 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS2P35442 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS2P35442 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS2P35442 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS2P35442 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS2P35442 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
THBS2P35442 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS2P35442 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS2P35442 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS2P35442 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS2P35442 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
THBS2P35442 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS2P35442 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS2P35442 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS2P35442 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
THBS2P35442 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS2P35442 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS2P35442 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS2P35442 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS2P35442 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
THBS2P35442 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS2P35442 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS2P35442 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS2P35442 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS2P35442 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
THBS2P35442 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS2P35442 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS2P35442 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS2P35442 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS2P35442 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
THBS2P35442 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS2P35442 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS2P35442 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
THBS2P35442 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS2P35442 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS2P35442 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS2P35442 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS2P35442 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS2P35442 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS2P35442 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
THBS2P35442 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS2P35442 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS2P35442 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS2P35442 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS2P35442 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS2P35442 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS2P35442 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS2P35442 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
THBS2P35442 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS2P35442 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS2P35442 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS2P35442 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
THBS2P35442 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS2P35442 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS2P35442 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS2P35442 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS2P35442 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
THBS2P35442 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS2P35442 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS2P35442 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS2P35442 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS2P35442 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS2P35442 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
THBS2P35442 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS2P35442 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS2P35442 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS2P35442 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS2P35442 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS2P35442 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS2P35442 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
THBS2P35442 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS2P35442 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS2P35442 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS2P35442 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS2P35442 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
THBS2P35442 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS2P35442 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
THBS2P35442 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms