Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFC1P35251 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFC1P35251 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RFC1P35251 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC1P35251 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC1P35251 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC1P35251 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RFC1P35251 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RFC1P35251 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RFC1P35251 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC1P35251 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC1P35251 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC1P35251 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC1P35251 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFC1P35251 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFC1P35251 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC1P35251 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC1P35251 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC1P35251 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFC1P35251 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFC1P35251 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFC1P35251 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC1P35251 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC1P35251 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC1P35251 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC1P35251 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFC1P35251 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC1P35251 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC1P35251 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC1P35251 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC1P35251 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RFC1P35251 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RFC1P35251 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFC1P35251 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFC1P35251 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFC1P35251 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFC1P35251 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFC1P35251 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFC1P35251 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFC1P35251 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFC1P35251 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFC1P35251 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFC1P35251 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFC1P35251 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFC1P35251 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFC1P35251 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFC1P35251 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFC1P35251 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFC1P35251 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RFC1P35251 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFC1P35251 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFC1P35251 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFC1P35251 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFC1P35251 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFC1P35251 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFC1P35251 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFC1P35251 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFC1P35251 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFC1P35251 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFC1P35251 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFC1P35251 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RFC1P35251 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFC1P35251 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFC1P35251 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFC1P35251 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFC1P35251 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFC1P35251 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFC1P35251 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFC1P35251 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFC1P35251 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFC1P35251 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFC1P35251 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFC1P35251 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFC1P35251 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFC1P35251 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFC1P35251 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFC1P35251 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFC1P35251 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RFC1P35251 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFC1P35251 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RFC1P35251 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms