Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC1P35052 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC1P35052 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GPC1P35052 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC1P35052 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC1P35052 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC1P35052 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC1P35052 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC1P35052 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC1P35052 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GPC1P35052 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GPC1P35052 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GPC1P35052 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC1P35052 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC1P35052 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC1P35052 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC1P35052 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GPC1P35052 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC1P35052 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC1P35052 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC1P35052 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC1P35052 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC1P35052 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GPC1P35052 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GPC1P35052 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPC1P35052 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC1P35052 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC1P35052 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC1P35052 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC1P35052 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPC1P35052 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC1P35052 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC1P35052 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPC1P35052 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC1P35052 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC1P35052 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC1P35052 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC1P35052 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPC1P35052 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GPC1P35052 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC1P35052 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC1P35052 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPC1P35052 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC1P35052 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPC1P35052 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC1P35052 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC1P35052 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC1P35052 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC1P35052 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC1P35052 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPC1P35052 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC1P35052 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC1P35052 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC1P35052 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPC1P35052 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GPC1P35052 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC1P35052 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC1P35052 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GPC1P35052 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC1P35052 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC1P35052 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC1P35052 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC1P35052 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPC1P35052 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC1P35052 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC1P35052 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC1P35052 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC1P35052 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC1P35052 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GPC1P35052 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GPC1P35052 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms