Protein–RNA interactions for Protein: P32238

CCKAR, Cholecystokinin receptor type A, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKARP32238 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKARP32238 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKARP32238 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKARP32238 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKARP32238 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKARP32238 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCKARP32238 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKARP32238 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKARP32238 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKARP32238 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKARP32238 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKARP32238 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCKARP32238 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKARP32238 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKARP32238 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCKARP32238 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKARP32238 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKARP32238 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKARP32238 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKARP32238 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKARP32238 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CCKARP32238 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCKARP32238 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKARP32238 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKARP32238 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKARP32238 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKARP32238 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKARP32238 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCKARP32238 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCKARP32238 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCKARP32238 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKARP32238 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKARP32238 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCKARP32238 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKARP32238 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKARP32238 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKARP32238 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKARP32238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKARP32238 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKARP32238 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKARP32238 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCKARP32238 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCKARP32238 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKARP32238 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKARP32238 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKARP32238 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKARP32238 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCKARP32238 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKARP32238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKARP32238 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCKARP32238 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKARP32238 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKARP32238 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCKARP32238 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKARP32238 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKARP32238 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKARP32238 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKARP32238 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKARP32238 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCKARP32238 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKARP32238 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKARP32238 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKARP32238 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKARP32238 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKARP32238 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCKARP32238 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKARP32238 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKARP32238 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKARP32238 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKARP32238 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKARP32238 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKARP32238 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCKARP32238 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKARP32238 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKARP32238 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKARP32238 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKARP32238 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKARP32238 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKARP32238 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKARP32238 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCKARP32238 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKARP32238 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKARP32238 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKARP32238 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKARP32238 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKARP32238 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCKARP32238 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKARP32238 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKARP32238 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKARP32238 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCKARP32238 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.6 ms