Protein–RNA interactions for Protein: P30613

PKLR, Pyruvate kinase PKLR, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKLRP30613 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKLRP30613 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKLRP30613 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKLRP30613 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKLRP30613 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKLRP30613 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PKLRP30613 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKLRP30613 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PKLRP30613 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKLRP30613 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKLRP30613 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKLRP30613 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKLRP30613 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKLRP30613 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKLRP30613 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PKLRP30613 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKLRP30613 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKLRP30613 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKLRP30613 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKLRP30613 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKLRP30613 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PKLRP30613 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKLRP30613 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PKLRP30613 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PKLRP30613 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
PKLRP30613 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKLRP30613 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKLRP30613 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PKLRP30613 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKLRP30613 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKLRP30613 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PKLRP30613 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKLRP30613 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKLRP30613 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKLRP30613 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKLRP30613 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKLRP30613 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PKLRP30613 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKLRP30613 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKLRP30613 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKLRP30613 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKLRP30613 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PKLRP30613 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKLRP30613 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKLRP30613 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PKLRP30613 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKLRP30613 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKLRP30613 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKLRP30613 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKLRP30613 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PKLRP30613 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKLRP30613 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKLRP30613 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKLRP30613 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PKLRP30613 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKLRP30613 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PKLRP30613 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKLRP30613 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKLRP30613 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKLRP30613 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKLRP30613 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PKLRP30613 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKLRP30613 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKLRP30613 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PKLRP30613 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKLRP30613 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKLRP30613 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKLRP30613 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKLRP30613 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PKLRP30613 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKLRP30613 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PKLRP30613 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKLRP30613 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKLRP30613 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKLRP30613 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKLRP30613 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKLRP30613 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKLRP30613 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKLRP30613 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PKLRP30613 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKLRP30613 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKLRP30613 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKLRP30613 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKLRP30613 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
PKLRP30613 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKLRP30613 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PKLRP30613 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PKLRP30613 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKLRP30613 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKLRP30613 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKLRP30613 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PKLRP30613 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms