Protein–RNA interactions for Protein: P30301

MIP, Lens fiber major intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPP30301 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MIPP30301 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MIPP30301 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MIPP30301 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MIPP30301 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIPP30301 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIPP30301 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIPP30301 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIPP30301 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIPP30301 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIPP30301 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MIPP30301 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIPP30301 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIPP30301 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIPP30301 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIPP30301 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MIPP30301 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MIPP30301 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MIPP30301 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MIPP30301 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIPP30301 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIPP30301 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIPP30301 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIPP30301 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
MIPP30301 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIPP30301 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MIPP30301 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIPP30301 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIPP30301 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIPP30301 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIPP30301 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIPP30301 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MIPP30301 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIPP30301 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIPP30301 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIPP30301 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIPP30301 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIPP30301 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIPP30301 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIPP30301 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MIPP30301 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIPP30301 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIPP30301 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIPP30301 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
MIPP30301 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIPP30301 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MIPP30301 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIPP30301 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIPP30301 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MIPP30301 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPP30301 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPP30301 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPP30301 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPP30301 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPP30301 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPP30301 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MIPP30301 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
MIPP30301 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIPP30301 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
MIPP30301 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MIPP30301 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIPP30301 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MIPP30301 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIPP30301 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIPP30301 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIPP30301 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIPP30301 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
MIPP30301 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPP30301 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPP30301 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPP30301 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPP30301 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPP30301 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPP30301 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MIPP30301 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPP30301 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPP30301 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPP30301 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPP30301 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MIPP30301 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPP30301 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPP30301 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPP30301 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPP30301 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MIPP30301 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms