Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN3P26045 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN3P26045 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN3P26045 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN3P26045 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms