Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
NFKBIAP25963 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIAP25963 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NFKBIAP25963 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NFKBIAP25963 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms