Protein–RNA interactions for Protein: P21757

MSR1, Macrophage scavenger receptor types I and II, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSR1P21757 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSR1P21757 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSR1P21757 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MSR1P21757 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MSR1P21757 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSR1P21757 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSR1P21757 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSR1P21757 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MSR1P21757 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MSR1P21757 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSR1P21757 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSR1P21757 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSR1P21757 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSR1P21757 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSR1P21757 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MSR1P21757 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSR1P21757 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MSR1P21757 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSR1P21757 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSR1P21757 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MSR1P21757 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSR1P21757 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSR1P21757 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSR1P21757 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSR1P21757 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MSR1P21757 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MSR1P21757 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSR1P21757 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSR1P21757 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSR1P21757 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MSR1P21757 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSR1P21757 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
MSR1P21757 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSR1P21757 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MSR1P21757 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSR1P21757 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSR1P21757 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSR1P21757 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSR1P21757 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MSR1P21757 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
MSR1P21757 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSR1P21757 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSR1P21757 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MSR1P21757 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSR1P21757 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
MSR1P21757 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSR1P21757 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSR1P21757 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSR1P21757 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
MSR1P21757 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSR1P21757 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MSR1P21757 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSR1P21757 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSR1P21757 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSR1P21757 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
MSR1P21757 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MSR1P21757 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MSR1P21757 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MSR1P21757 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms